AMIKOM COMPUTER CLUB disingkat AMCC, didirikan pada tanggal 6 Mei 1996. AMCC adalah sebuah Unit Kegiatan Mahasiswa yang berfokus pada ilmu komputer. Pada awalnya, AMCC merupakan sebuah komunitas yang terdiri dari mahasiswa AMIKOM yang memiliki minat yang sama dalam bidang komputer. AMCC adalah tempat di mana rekan-rekan mahasiswa dapat berbagi pengetahuan dan mencari solusi ketika menghadapi masalah dalam dunia komputer. AMCC memiliki visi untuk menjadi "Organisasi IT Terbaik di Jogja" dan terbagi menjadi 5 Divisi Pelatihan yaitu Web Programming, Data Science, Mobile Programming, Computer Network, dan Hardware-Software.
Komunitas Multimedia Amikom (KOMA) merupakan suatu organisasi dalam Unit Kegiatan Mahasiswa yang bergerak di bidang multimedia. KOMA memiliki 4 divisi keilmuan yaitu Graphic Design, UI/UX Design, Film, dan Animation. KOMA berdiri dan diresmikan menjadi Unit Kegiatan Mahasiswa oleh Lembaga Universitas Amikom Yogyakarta pada tanggal 27 Mei 2001 dengan Surat Keputusan Pembantu Direktur III Universitas Amikom Yogyakarta bernomor 003/SK/PUDIR.III/AMIKOM/VI/2001.
Divisi Graphic Design merupakan divisi yang mempelajari desain berbasis vector dan bitmap yang menghasilkan karya logo, poster, mockup dan sebagainya. Software yang digunakan ada Adobe Illustrator dan Adobe Photoshop.
Divisi UI/UX Design merupakan divisi yang mempelajari dan membahas tentang pembuatan tampilan/Mockup dan prototyping pada web dan juga mobile yang interaktif untuk penggunanya, software yang digunakan ada Figma dan lainnya.
Divisi Film merupakan divisi yang mempelajari dan membahas bagaimana cara menyampaikan informasi dengan cerita dan penyampaian yang menarik, pengambilan gambar dan editing yang baik, serta alur dan pembuatan film yang baik dan menarik.
Divisi Animation merupakan divisi yang mempelajari dan membahas tentang pembuatan 3D, motion graphic, matte painting, dan masih banyak lainnya, software yang digunakan ada Blender dan Adobe After Effect.
Selain kegiatan pembelajaran bersama divisi keilmuan, KOMA juga memiliki event yang berskala nasional yaitu TEBAS atau The Best Annual Multimedia Show yang mana merupakan ajang perlombaan multimedia tahunan tingkat Nasional yang bergengsi untuk mengembangkan kreativitas kreator-kreator muda Indonesia. Selain TEBAS ada Seminar Nasional, KOMACADEMY, KOMABAKSOS dan masih ada event lainnya lagi.
AMIKOM English Club atau biasa dikenal dengan AEC adalah bagian dari Unit Kegiatan Mahasiswa Universitas AMIKOM Yogyakarta yang merupakan kumpulan mahasiswa yang berminat belajar dan meningkatkan kemampuannya dalam berbahasa Inggris. UKM AMIKOM English Club Universitas AMIKOM Yogyakarta didirikan di Yogyakarta pada tanggal 20 Januari 2001. Unit Kegiatan Mahasiswa Amikom English Club (AEC) Universitas AMIKOM Yogyakarta berkedudukan di Gedung BSC lantai tiga ruang tujuh. Dalam struktur keorganisasiannya, AMIKOM English Club memiliki Badan Pengurus Harian (BPH), yang mana Badan Penurus Harian ini berisikan Presiden, Wakil Presiden, Sekretaris dan Bendahara. Lalu terdapat juga departemen-departemen yang dibawahi langsung oleh Badan Pengurus Harian (BPH). Departemen tersebut adalah Event Organizier (EO) yang bertugas untuk merancang acara-acara yang akan dilaksanakan oleh AMIKOM English Club. Public Relation (PR) bertugas untuk menjalani komunikasi internal maupun eksternal organisasi dan juga mengaktifkan media sosial yang dimiliki oleh AMIKOKM English Club. General Conversation (GC) adalah departemen pada lingkup keilmuan didalam struktur organasasi, dimana bertugas untuk Menyusun silabus atau kurikulum selama satu priode kepengurusan. Dan yang terakhir adalah Englush Debate Society (EDS) yaitu departemen yang berfokus melatih kemampuan berdepat dalam Bahasa Inggris, departemen ini juga nantinya akan aktif mengikuti lomba-lomba yang berbasis ada Bahasa Inggris.
UKM FOSSIL (Free Open Source Software Interest League) adalah organisasi mahasiswa yang aktif di Universitas AMIKOM Yogyakarta yang didedikasikan untuk mempromosikan dan mengembangkan minat dalam Perangkat Lunak Sumber Terbuka (Open Source Software). Organisasi ini didorong oleh sekelompok individu penggemar teknologi dan kontributor open-source yang bertujuan untuk menjadi bagian penting dari ekosistem Open Source Software dengan menawarkan pelatihan dan kesempatan pengembangan keterampilan.
Tujuan utama UKM FOSSIL adalah menciptakan komunitas yang solid bagi mahasiswa yang antusias terhadap perangkat lunak sumber terbuka serta mendorong partisipasi aktif mereka dalam berbagai proyek Open Source Software. Dengan menyelenggarakan lokakarya, seminar, dan sesi pelatihan langsung, UKM FOSSIL memberikan pengetahuan dan keterampilan yang diperlukan kepada para anggotanya untuk berkontribusi dalam pengembangan dan perbaikan perangkat lunak sumber terbuka. Hal ini tidak hanya bermanfaat bagi para mahasiswa sendiri, tetapi juga menambah nilai pada komunitas open-source yang lebih luas.
Selain itu, UKM FOSSIL berperan sebagai platform bagi para mahasiswa untuk berjejaring dengan individu seangkatan yang memiliki minat serupa, bertukar ide, dan berkolaborasi dalam proyek-proyek. Komitmen organisasi ini dalam mempromosikan prinsip-prinsip open source, termasuk transparansi, kolaborasi, dan berbagi, berkontribusi pada budaya Open Source Software yang berkembang di lingkungan kampus. Dengan semangatnya terhadap Open Source Software dan dedikasinya dalam berbagi pengetahuan, UKM FOSSIL memainkan peran penting dalam membina generasi berikutnya dari pendukung dan kontributor Open-Source.
Lembaga Pers Mahasiswa Journal merupakan wadah bagi para Mahasiswa Universitas Amikom Yogyakarta yang memiliki minat akan Jurnalistik serta Organisasi.